عقد في عام 1970 أول مؤتمر إسلامي لوزراء الخارجية في جدة وقرر إنشاء أمانة عامة للمنظمة يكون مقرها في جدة كمقر مؤقت إلى أن يتم تحرير مدينة القدس التي تعتبر المقر الرسمي للمنظمة التي يرأسها أمين عام، ويعتبر الدكتور أكمل الدين إحسان أوغلو الأمين العام الحالي للمنظمة تاسع أمين عام، وقد تولى هذا المنصب في كانون الثاني عام 2005 بعد أن انتخبه المؤتمر الإسلامي لوزراء الخارجية في دورته الواحدة والثلاثين، وفي المؤتمر الإسلامي الثالث عام 1972 تم تبني ميثاق المنظمة السابق، بينما اعتمد الميثاق الحالي لمنظمة المؤتمر الإسلامي في القمة الإسلامية الحادية عشرة التي عقدت في داكار يومي 13 و14 آذار 2008 وقد حدد الميثاق الجديد أهداف المنظمة ومبادئها وغاياتها الأساسية التي تهدف إلى تعزيز التعاون والتضامن بين الدول الإسلامية في كافة المجالات السياسية والاقتصادية والعلمية والثقافية والاجتماعية ولا سيما في:‏