نتيجة الاصابة بالآفات مثل ذبابة الثمار وغيرها من الآفات حيث ترتفع حموضة الزيت مع ظهور لطعم ورائحة غير مرغوبين وتصبح الثمار غير صالحة للتحليل مع عدم امكانية التخزين لفترات طويلة لزيت الزيتون. كما ناقشت الورشة طريقة مكافحة الآفات وضرورة مراقبة الحقل بهدف الوصول الى المكافحة بالوقت المناسب وبالطريقة المناسبة اذا اصيب الحقل بإحدى الآفات. كما اقامت وزارة الزراعة ورشة اخرى في محافظة اللاذقية حول مكافحة ذبابة الفاكهة التي تصيب الحمضيات والقيت عدة محاضرات حول الامراض الفطرية والفيروسية والحشرات القشرية التي تصيب الحمضيات والطفيليات والمفترسات لاهم آفات الحمضيات.‏