كما يوفر النظام النفقات التشغيلية والوقت والجهد المترتب على النظام اليدوي السائد حالياً، إذ يزيد النظام من كفاءة وسرعة التدفق النقدي بين المتعاملين والبنوك ما يؤدي إلى تحسين الأداء المصرفي بصورة عالية وفعالة.ونظام المقاصة الالكترونية يوفر تصوير الشيكات والتعرف الضوئي على الأحرف وقراءة الخط المغناطيسي وإدخال البيانات وتخزين صورة الشيك وبياناته واستحضار صورة الشيك وبياناته، والتحكم في مسار العملية، وإصدار التقارير وعمل الاستفسارات، والشيكات القابلة للدفع الفوري، ومعالجة قوائم الشيكات غير القابلة للدفع، ومعالجة الشيكات آجلة الدفع والربط مع الأنظمة الأخرى. وتطبيق نظام المقاصة الالكتروني يتطلب تعديلات في إجراءات العمل، وتعليمات وأصول وقواعد المقاصة، أما أهدافه فتتمثل بتحويل عملية تقاص وإعادة الشيكات لتصبح الكترونية، والتوقف عن تداول الشيكات من اجل التقاص عند مرحلة الإيداع، وخلق فرص جديدة لإدارة أرصدة البنوك، كما يفيد هذا المشروع في تحصيل قيمة الشيكات خلال فترة وجيزة في نفس يوم تقديم الشيك، ويساهم هذا النظام باعتماد غرفة مقاصة واحدة لجميع المناطق، كما يوفر إحصائيات دقيقة عن عدد الشيكات الصادرة ، الواردة ، المعادة ومبالغها، ويسهّل عملية حفظ (بيانات الشيكات وصورها) واسترجاعها، وإلى ما هنالك .‏